一个开源人类基因组数据库的想法
xjp132014/08/11生物学 IP:四川
本帖最后由 xjp13 于 2014-8-11 18:33 编辑

         现在越来越多的行业将知识”傻瓜化“,方便越来越多的人使用,受此启发,我们想整理出一个人类基因组开源数据库,这里需要解释一下,人类的基因组数据本身是开放的,任何人都可以查询,但像NCBI,UCSC,OMIM这样的专业数据库是供科研人员查询使用,对数据库如果不熟悉完全看不懂。我们想构建的这个数据库是从这些专业的数据库里整理出人类基因的相关数据信息,然后用一些比较傻瓜化的查询方式,争取在完全没有生物信息学基础的情况下,让普通人5分钟学会查询人类基因数据。带动广大生物GEEK开始玩转基因。对社会科普也有很大好处。随着目前测序成本的急速下降,预计5年左右可降到1000元(目前1万元左右),也就是说5年内大家可以花千元拿到自己的基因组数据,那么届时将有庞大的数据分析。大家看看有什么想法,可以提出来讨论。
        补充:一个人的基因组数据大概30亿字节,也就是3G左右。压缩包可压缩到800M左右。需要的联系我,我发给你一份

基因组压缩包.jpg
      应大家要求,我把压缩包上传到网盘:XXXXXXXXXXXXXXXXXXXX/s/1dDksWId         fa文件用UltraEdit就可打开。压缩包里是每条染色体的小压缩包,可以单独解压每一条染色体的,建议解压小点的先看看。

+30  科创币    发电机    2014/08/11 感谢分享
+1  学术分    虎哥    2014/09/14 本帖符合加学术分的标准,鼓励!
加载全文
来自:生物医药 / 生物学
57
已屏蔽 原因:{{ notice.reason }}已屏蔽
{{notice.noticeContent}}
~~空空如也
虎哥
10年4个月前 IP:未同步
715726
这东西结合大数据(尽管我也没搞明白这是什么),应该可以很牛逼的,关键问题是中间的工具链建设,要搞得跟玩arduino一样容易,一千万人没事就折腾,就会有许多新进展的。
引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
xjp13作者
10年4个月前 IP:未同步
715747
虎哥 发表于 2014-8-25 23:53
这东西结合大数据(尽管我也没搞明白这是什么),应该可以很牛逼的,关键问题是中间的工具链建设,要搞得跟 ...


是的,虎哥,我们的想法就是要搞得和arduino一样容易,五分钟上手是目标![s:12]
引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
冷血
6年1个月前 IP:新疆
852066

方便给我传一份。79646694@qq。com。我们这打不开网盘

引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
张静茹
6年1个月前 修改于 6年1个月前 IP:江苏
852068

楼主言中了 这才不到五年 就几百块了,

3GB能压缩到800M  人类基因重复冗余的好多呀

引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
虎哥
6年1个月前 IP:四川
852069
引用张静茹发表于54楼的内容
楼主言中了 这才不到五年 就几百块了,3GB能压缩到800M  人类基因重复冗余的好多呀

如果做足够深度的测序,还是要上万元,一点都不便宜。几百元的那种纯属忽悠。

引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
张静茹
6年1个月前 IP:江苏
852102
引用虎哥发表于55楼的内容
如果做足够深度的测序,还是要上万元,一点都不便宜。几百元的那种纯属忽悠。

各色基因那种不靠谱吗?

引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论
BI4LNE
6年1个月前 IP:美国
852153

山寨云网盘限速比较厉害,这800M可能要下到猴年马月

给楼主介绍一个Mozilla实验室项目, XXXXXXXXXXXXXXXX ,上传上去之后任何知道链接的人都能下载,关键是无墙无限速

引用
评论
加载评论中,请稍候...
200字以内,仅用于支线交流,主线讨论请采用回复功能。
折叠评论

想参与大家的讨论?现在就 登录 或者 注册

所属专业
上级专业
同级专业
xjp13
学者 笔友
文章
5
回复
60
学术分
1
2010/10/18注册,4年11个月前活动
暂无简介
主体类型:个人
所属领域:无
认证方式:邮箱
IP归属地:未同步
文件下载
加载中...
{{errorInfo}}
{{downloadWarning}}
你在 {{downloadTime}} 下载过当前文件。
文件名称:{{resource.defaultFile.name}}
下载次数:{{resource.hits}}
上传用户:{{uploader.username}}
所需积分:{{costScores}},{{holdScores}}下载当前附件免费{{description}}
积分不足,去充值
文件已丢失

当前账号的附件下载数量限制如下:
时段 个数
{{f.startingTime}}点 - {{f.endTime}}点 {{f.fileCount}}
视频暂不能访问,请登录试试
仅供内部学术交流或培训使用,请先保存到本地。本内容不代表科创观点,未经原作者同意,请勿转载。
音频暂不能访问,请登录试试
支持的图片格式:jpg, jpeg, png
插入公式
评论控制
加载中...
文号:{{pid}}
投诉或举报
加载中...
{{tip}}
请选择违规类型:
{{reason.type}}

空空如也

加载中...
详情
详情
推送到专栏从专栏移除
设为匿名取消匿名
查看作者
回复
只看作者
加入收藏取消收藏
收藏
取消收藏
折叠回复
置顶取消置顶
评学术分
鼓励
设为精选取消精选
管理提醒
编辑
通过审核
评论控制
退修或删除
历史版本
违规记录
投诉或举报
加入黑名单移除黑名单
查看IP
{{format('YYYY/MM/DD HH:mm:ss', toc)}}