微波这东西，如果只看热效应，伤害最大的是缺少血液循环，同时又能吸收微波的组织（可以理解为含水适当）。那么，晶状体，中枢神经就是比较危险的。但是中枢神经有脑脊液保护着，热容量大，剩下的就只有晶状体之类了。而晶状体里面没神经，坏死也不会马上导致视力改变，也就是说，煮熟了也不会感觉到痛，于是不知道跑，不知不觉就坏了。等过一段时间透明度下降，屈光不正，导致视力伤害，已经来不及后悔啦。
不同频率的微波作用深度不同，像微波炉磁控管产生的可以深入一两厘米加热的微波，既不能迅速产生武器的失能或致死效果（需要很大功率，且作用慢，极不人道），又不能产生迅速的驱避效果（作用深度不是人体最敏感的部位），除了恐怖分子感兴趣外，实在是毫无实际价值。