一般来说，程序没必要使用WinAPI编写，太麻烦了。

如果可以接受.NET框架的话（一般是应用软件和一般的工具软件）——
如果可以接受.NET框架，要完全原生的体验，用Windows Forms。
如果可以接受.NET框架，内存足够大，想把界面做得华丽一些，用WPF。

如果不能接受.NET框架的话（一般是运行环境特殊的工具软件或跨平台软件）——
如果不能接受.NET框架，界面要求原生的体验，用wxWidgets。
如果不能接受.NET框架，想把界面做得华丽一些，用Qt。
如果不能接受.NET框架，也不能接受C++的话，用GTK+。

如果不能接受.NET或其它的框架，只需要非常简单的GUI界面的话，用Win32对话框。
如果不能接受.NET或其它的框架，而且不需要GUI界面的话，用控制台程序。