回归楼主最早的问题，为何楼主会认为自然保护区一旦建立就会与大环境隔绝？难道用玻璃罩把几千平方公里的地区给罩起来了？这本身就有问题。保护区的意义在于给濒危物种一块休养生息的地方，就像捕鱼有休渔期那样。然后下面一堆人在东拉西扯....
再说为何要保护那些个濒危物种。人类做出的任何行为都是会和自身相干的，保护物种多样性必然跟人类存亡有关系。有些物种要保护起来很明显，比如蜜蜂，对人类的贡献显而易见的；另一些物种，也许并没有很显著的益处，但存在潜在的利用价值。比如历史上我国把麻雀列为四害，然后的事情大家也都知道了......还有些，比如超级杂交稻的产生，归功于野生的雄性不育株，这种植物一般人看来就是杂草。又如香蕉这种植物，目前商业种植的香蕉的基因多样性非常低，因为没有种子，完全靠分株繁殖。就连一个简单的枯萎病都能摧毁整个香蕉行业。这时候那些在保护区里的野生香蕉就有作用了，上个月看到在东南亚雨林里发现新品种香蕉，抗病强，但是极度濒危，发现的也就几十株样本。
然后就说说大熊猫这种典型的“无用”的濒危物种的意义，这种其实才是楼主觉得真正应该灭绝掉的物种，上古孑遗，存世量少，除了卖萌之外一无是处。保护这类物种除了上面说的可能会有潜在的利用价值外，最主要的是作为一个形象而存在的，大熊猫只是个代表，正因为卖得一脸好萌，所以拿出来作为宣传，社会会因为喜爱这个形象而加大对保护大熊猫的投入，比如研究资金、或者建立保护区。那么这个保护区不仅仅保护了大熊猫，还有其他一大票濒危动物都能受益，这才是科学家们的阴谋...因为拿得上台面的濒危物种毕竟少数，大熊猫属于逆天级别的，大部分物种都是像蛤蟆、老鼠之类的，太难看。
至于有人认为可以把所有物种的基因都数字化起来。首先目前连转基因都无法接受的，更别提基因保存计划了。其次还有很多未知物种，根本不知道其存在，也就无法收集，这也是建立保护区的另一个重要原因——保护未知物种。目前国际上也有把濒危物种全部抓回来，在实验室培养的，但仅限于保护区计划失败，个体数量掉到无法自然维持物种的情况，风险也极大，很可能全养死了.....我国和日本对朱鹮的保护就是个例子。
其实建立保护区是相对来说最经济的办法，只要一点点节制，以及合理规划，就可以划分出一块不加以干涉的区域。而由保护濒危物种所带来的附加效益，并不是钱能衡量的。
